文章标题：昆虫质型多角体病毒同义密码子使用模式分析（重发）

文章作者：石生林，姜义仁，杨瑞生，刘彦群，赵金莹，秦利
关 键 词：有效密码子数，ENc-plot分析，中性绘图分析，对应分析，偏好性密码子
文章摘要：昆虫质型多角体病毒（cypovirus, CPV）是害虫种群重要调节因子，可用作生物防治剂。本研究采用多元统计分析方法对7种CPV进行密码子使用模式分析，结果表明：CPV密码子使用偏好性较弱，多数基因密码子使用模式受碱基组成影响，少数基因密码子使用模式除碱基组成外还有其它影响因素；中性绘图分析表明碱基组成主要受选择压力影响，受突变影响较小。同一电泳型CPV之间比同一宿主CPV之间共有的偏好性密码子多。CPV基因组内10个基因组片段之间密码子偏好性存在差异。CPV密码子偏好性与宿主昆虫密码子偏好性存在差异，所有CPV与其宿主昆虫共有的偏好性密码子均较少。对应分析进一步证明碱基组成是影响密码子使用的主要因素，不同电泳型CPV具有不同的密码子使用模式。聚类分析表明同一电泳型CPV密码子使用模式相似，同一宿主CPV密码子使用模式差异较大。