《应用昆虫学报》

文章标题:昆虫RNASeq数据的分析流程

文章作者:刘金定1,2张赞1黄水清2李飞1
关 键 词:高通量RNA测序,段序列比对,转录组拼接,基因功能注释,基因表达定量,基因差异表达
文章摘要:


随着高通量RNA测序(RNASeq)技术的发展和测序成本迅速下降,RNASeq技术已经成为生物学研究的重要工具,为生物学家全面地了解和研究转录组提供了机遇。高通量测序具有读长短、存在一定比例的测序错误、数据量大等特点,因此RNASeq数据分析与基因组分析和传统的EST数据分析有所不同。本文通过介绍不同的测序平台、原始数据产生和低质量数据过滤的计算流程,对短序列比对、转录组拼接、功能注释、以及差异表达分析进行了研究和分析,最后对RNASeq在昆虫学研究中的应用进行了综述,并对RNASeq技术进行了总结和展望。