《应用昆虫学报》

文章标题:云南切梢小蠹气味结合蛋白的同源模建

文章作者:汪 宇1** 孙 浩2 朱家颖1 赵 宁1 杨 斌1***
关 键 词:气味结合蛋白,同源模建,三维结构,云南切梢小蠹
文章摘要:

 【目的】 为了研究云南切梢小蠹Tomicus yunnanensis气味结合蛋白(Odorant binding proteinsOBPs)参与其嗅觉识别过程的机理奠定基础,本文对云南切梢小蠹OBP进行了同源模建及评价分析。   【方法】 采用同源模建方法构建了云南切梢小蠹OBP的三维结构,并利用ProcheckVerify_3DERRAT等方法评估了构建模型的可靠性。【结果】 对优化后的模建蛋白的结果分析发现,序列中有6个保守的半胱氨酸位点,具有气味结合蛋白的典型特征,并且ProcheckVerify_3DERRAT对模型的评价分数较高,结构具有很高的可能性。【结论】 基于已知的同源蛋白结构信息和模建蛋白的一级序列信息,预测序列已知但结构未知的蛋白空间结构,为今后研究该云南切梢小蠹气味结合蛋白的功能结构域奠定基础。