文章标题：基于DNA条形码的物种界定算法比较研究

文章作者：金 倩1, 2** 武春生3 陈 芬1 罗桂杰1 蔡卫佳1 刘 旭1 杨采青2
关 键 词：舟蛾科，DNA条形码，物种界定，GMYC，ABGD，jMOTU
文章摘要：

【目的】 为了探究3种常用物种界定方法（jMOTU、ABGD、GMYC）的界定效果。【方法】本研究以中国北京周边地区10个采样点483个舟蛾科样品为例，利用线粒体细胞色素C 氧化酶Ⅰ亚基基因（Cytochrome c oxidase subunitⅠ gene，COⅠ或COX1，约650 bp）的部分序列，进行3种物种界定算法（jMOTU、ABGD、GMYC）的实例比较研究。【结果】3种物种界定方法的鉴定效力存在差异，与形态学结果相比较，ABGD方法划分物种的准确率为100%，基于BEAST的GMYC模型结果与形态学结果一致，产生的置信区间（64~68）覆盖了形态学的结果（67）。然而，基于d8tree/MPLtree的GMYC方法倾向于高估MOTUs，jMOTU方法倾向于低估物种数目。【结论】 结果显示，ABGD方法和基于BEAST的GMYC模型方法对于本文研究对象舟蛾科能够较好地划分，可以对基于形态学的物种界定进行有效补充。