文章标题：意大利蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌 早期胁迫的转录组学分析

文章作者：郭 睿** 熊翠玲** 郑燕珍 张 璐 童新宇 梁 勤 陈大福***
关 键 词：意大利蜜蜂，幼虫肠道，球囊菌，转录组
文章摘要：

【目的】 球囊菌特异性地侵染蜜蜂幼虫而导致白垩病，该病造成成年蜜蜂数量的大幅下降，从而严重影响蜂蜜等产品的产量。目前，尚无利用二代测序技术研究白垩病的报道。本研究利用RNA-seq技术对正常及球囊菌胁迫后的意大利蜜蜂4日龄幼虫肠道进行深度测序，为解析宿主响应球囊菌胁迫的应答机制提供了重要的参考信息。【方法】 利用Illumina Hiseq 2500平台对对照组（AmCK）和处理组（AmT）幼虫肠道进行双端（PE125）测序；利用Perl脚本进行下机数据过滤；利用R软件进行测序饱和度分析、计算各样品之间的相关性系数；利用SOAP aligner/soap2软件将未比对上核糖体的读段（Reads）比对到意大利蜜蜂参考基因组；基于GO数据库和KEGG数据库进行GO分类和KEGG代谢通路（Pathway）富集分析。【结果】 RNA-seq共得到181 096 194条原始读段（Raw reads），经过滤得到179 078 764条有效读段（Clean reads）。差异表达基因（DEGs）分析结果显示上调与下调基因的数量分别为4和20个。DEG的基因本体论（Gene ontology，GO）分析结果显示，这些DEGs分布于10个GO分类，除归入结合（Binding）的基因和催化活性（Catalytic activity）的部分基因外，绝大多数GO分类上的基因均表现为下调。DEGs的KEGG代谢通路分析结果显示各有1个DEG分别富集在核糖体和氧化磷酸化且均下调表达。【结论】 本研究揭示了意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌入侵早期的胁迫应答，为解析宿主响应球囊菌胁迫的应答机制奠定了基础。