文章标题：基于基因组特异性SSR序列的 实蝇PCR鉴定方法

文章作者：丁思敏；王书平；贺 康；李 飞；蒋明星
关 键 词： 实蝇，简单重复序列，物种特异性引物，PCR，检疫
文章摘要：

【目的】 实蝇科昆虫是全球范围内重要的检疫性害虫，其幼虫取食寄主果实，引起果实腐烂、变质，造成巨大经济损失。由于口岸截获多为实蝇卵、幼虫、蛹等非成虫虫态，需饲养至成虫才能根据形态准确鉴定，因此快速可靠的分子鉴定技术体系亟需完善。【方法】 利用公开发表的实蝇基因组序列，通过生物信息学方法从4种检疫性实蝇即地中海实蝇Ceratitis capitata、瓜实蝇Bactrocera cucurbitae、橘小实蝇Bactrocera dorsalis、昆士兰实蝇Bactrocera tryoni中挖掘物种特异性的简单重复序列（Simple sequence repeats，SSR），针对各物种设计含有其特异性简单重复序列的引物，提取实蝇样品基因组DNA，采用常规PCR方法优化并筛选各物种特异性引物。【结果】 在4种实蝇基因组中共发现20条物种特异性的SSR，基于这些序列设计的3对特异性引物能有效区分地中海实蝇、瓜实蝇和橘小实蝇，扩增片段大小分别为1 251、1 307、823 bp，而在其他物种中检测不到条带。【结论】 基因组水平的序列分析发现了物种特异性的SSR，通过筛选获得物种特异性的PCR引物，可应用于3种实蝇的分子鉴定，为口岸检疫人员快速鉴定区分非成虫状态的实蝇提供了实用性技术。