文章标题：光肩星天牛气味结合蛋白AglaOBP12同源建模及与乙酸-顺-3-己烯酯的分子对接研究

文章作者：赵新民** 李滔滔 彭晓赟 刘石泉
关 键 词：光肩星天牛；气味结合蛋白；AglaOBP12；乙酸-顺-3-己烯酯；同源建模；分子对接
文章摘要： 

 【目的】 研究光肩星天牛Anoplophora glabripennis气味结合蛋白AglaOBP12与寄主植物挥发物乙酸-顺-3-己烯酯的相互作用机制，为利用化学生态手段调控光肩星天牛行为提供理论依据。【方法】 采用同源建模预测AglaOBP12三维结构，虚拟氨基酸突变构建两个突变子，利用Molegro Virtual Docker程序进行分子对接研究AglaOBP12与乙酸-顺-3-己烯酯的结合模式。模型的合理性评价采用GMQE、QMEAN、ramachandran图和Verify-3D。【结果】 AglaOBP12的三维结构由6个α-螺旋构成且形成锥形疏水口袋结构。6个保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成稳定结构的3个二硫键。AglaOBP12的C端疏水性氨基酸位于结合口袋的出口并对口袋形成一定的遮挡。乙酸-顺-3-己烯酯位于疏水口袋中与疏水性氨基酸发生作用，而亲水头部羰基氧原子则与Asn123产生氢键。在与突变子N123A的对接中，乙酸-顺-3-己烯酯更接近疏水口袋的出口，乙酸-顺-3-己烯酯与C端Phe135形成氢键。而在与突变子F135E/L136E/V137E的对接中，乙酸-顺-3-己烯酯位于疏水口袋较深处，但未发现与Asn123氢键作用，相比野生型，两个突变子的对接空间能和范德华尔能增大，结合稳定性下降。【结论】 乙酸-顺-3-己烯酯位于AglaOBP12疏水口袋并通过氢键与Asn123形成稳定的复合物，AglaOBP12的Asn123和C端疏水氨基酸对结合乙酸-顺-3-己烯酯具有重要作用。