杀虫剂抗性基因的突变对昆虫生理生化的影响体现为种群适合度的变化。种群抗性等位基因频率和生物学适合度可用来表征抗性昆虫相对适合度。抗性相关靶标和代谢酶的突变会改变昆虫正常的生理功能，抗性基因过量表达会引起昆虫体内生理能量分配失衡，两者均会造成抗性代价。但是，抗性等位基因置换和修饰基因可以抵消抗性代价。抗性昆虫相对适合度的表现型取决于抗药性形成的遗传背景和抗性水平。此外，其表现型还受到各种生态因素的影响。抗性昆虫相对适合度的研究结果可为预测抗药性发展趋势、开展抗药性治理提供科学依据。