应用rDNA-ITS2基因序列对云南各地理种群西花蓟马Frankliniella occidentalis （Pergande）的遗传结构和遗传分化程度进行初步研究。经过比对112条序列，共发现了59个变异位点，定义了30种单倍型。云南省西花蓟马的单倍型多态性较高（Hd=0.90219），而核酸多态性较低（Pi=0.00891）。各地理种群西花蓟马的遗传分化指数Fst为0.00810，基因流Nm为30.61，表明各地理种群间遗传分化程度非常低，种群间存在充分的基因交流。对群体进行中性检验、错配分析表明西花蓟马群体曾经历过近期的种群扩张。分子方差分析（AMOVA）表明，云南西花蓟马的遗传变异主要来自于种群内部，种群间的遗传变异水平还非常低。从分子生物学的角度上也证实了西花蓟马近期入侵云南的事实。