《应用昆虫学报》

文章标题:线粒体基因组数据的分析方法和软件

文章作者:李雪娟,杨婧,王俊红,任倩,李霞,黄原**
关 键 词:线粒体基因组, 拼接, 注释
文章摘要:

线粒体基因组的研究已经普及, 其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。本文以Staden Package软件为主介绍了拼接和注释的线粒体基因

组的方法,同时介绍了其他常用的拼接软件ContigExpress、DNAMAN、DNASTAR、BioEdit和Sequencher,以及利用不同软件(包括DOGMA、

MOSAS、MITOS、GOBASE、OGRe、MitoZoa、tRNAscanSE、ARWEN、BLAST和MiTFi等)对线粒体基因组中的蛋白质编码基因、rRNA、tRNA和A+T

富集区进行注释的方法,最后介绍了利用MEGA5软件分析线粒体基因组的组成、Sequin软件提交序列和线粒体基因组数据绘图工具(CG view、

MTviz和OGDRAW)。