
拟黑多刺蚁肌细胞增强因子2(MEF2)生物信息学分析
Bioinformatics analysis of MEF2 gene of Polyrhachis vicina
郭新军1,2,奚耕思1**
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DOI:
作者单位:.陕西师范大学生命科学学院 西安 710062; 2 西安文理学院 生命科学系 西安 710065
中文关键词: 拟黑多刺蚁, 肌细胞增强因子2(MEF2), 生物信息学
英文关键词:Polyrhachis vicina,myocyte enhancer factor 2 (MEF2),bioinformatics analysis
中文摘要:
应用NCBI上的常用程序、ExPASy在线核苷酸序列分析工具、CBS生物学序列分析工具及SABLE在线分析软件等对拟黑多刺蚁Polyrhachis vicina Roger肌细胞增强因子2(PvMEF2)进行了生物信息学分析,获得了PvMEF2因子的序列特征及理化性质,并对其结构和功能结构域进行了预测。结果表明PvMEF2因子具有与已知种类MEF2因子较高一致性的MADS和MEF2结构域,并且理化性质和二级结构、三级结构等与果蝇该因子类似,反映了PvMEF2可能是参与拟黑多刺蚁肌肉发生调控的重要因子。
英文摘要: The analytical tools NCBI, ExPASy and CBS were adopted to analyze the bioinformatic properties of the PvMEF2 protein, such as sequence characteristics, physicochemical properties, structure and functional domains. The results show that PvMEF2 has conserved MADS and MEF2 domains and that its physicochemical properties, secondary and tertiary structures are similar to those of the MEF2 protein of Drosophila melanogaster. PvMEF2 protein may play an important role in myogenesis in Polyrhachis vicina Roger.