程序化设计简并引物与克隆小菜蛾酯酶基因
Automated programming of degenerate primers and the cloning of the diamondback esterase gene.
黄菁;王少丽;乔传令
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DOI:
作者单位:中国科学院动物研究所,农业虫鼠害综合治理研究国家重点实验室,北京100080
中文关键词:简并引物设计;CodeHop;昆虫酯酶基因;RTPCR
英文关键词:degenerate primer design; CodeHop insect esterase gene; RT-PCR
中文摘要:利用遗传密码简并性 ,针对特定的氨基酸序列设计简并引物 ,是克隆蛋白质家族cDNA的常规方法。文章介绍了利用blastp ,blockmaker,CodeHop ,SwissProt,SpTrEMBL等网络工具及数据库设计昆虫抗性酯酶的简并引物。用这对引物从抗有机磷杀虫剂的小菜蛾Plutellaxylostella中克
英文摘要:It is a normal strategy to clone protein family cDNA using the degeneracy of the code to design PCR primers from protein multiple-sequence alignments. With the tools of blastp, blockmaker, CodeHop, SwissProt,and SpTrEMBL, degenerate primers were designe