刊期:双月刊
主管单位:中国科学院
主办单位:中国科学院动物研究所,中国昆虫学会
地址:北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮编:100101
电话:010-64807137
传真:010-64807137
E-Mail:entom@ioz.ac.cn
刊号:ISSN 2095-1353
        CN 11-6020/Q
国内发行代号:2-151
国际发行代号:BM-407
发行范围:国内外公开发布
定价:138元/册
定价:828元/年
银行汇款:中国工商银行北京海淀西区支行
户名:中国科学院动物研究所
帐号:0200 0045 0908 8125 063

您所在位置:首页->过刊浏览->2015年52卷第2期



基于RNA-Seq分析Ras1CA在家蚕后部丝腺过表达对细胞周期通路基因的影响
RNA-Seq technology based transcriptomic analysis of differentially expressed genes in the cell cycle pathway of Ras1CA-overexpressedand wild type posterior silk glands of Bombyx mori
马 倩1, 2** 马 俐2 李 胜2 李 恺1***
点击:1481次 下载:17次
DOI:10.7679/j.issn.2095-1353.2015.043
作者单位:1. 华东师范大学生命科学学院,上海 200241;2. 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,上海 200032
中文关键词: 转录组学,转基因家蚕,Ras1CA过表达,细胞周期基因
英文关键词:
中文摘要:

【目的】 文旨在挖掘野生型家蚕Bombyx moriRas1CA过表达转基因家蚕后部丝腺中的转录本差异,分析和验证细胞周期通路中的差异表达基因,从而探讨Ras1CA过表达转基因家蚕提高蚕丝产量的分子机制。【方法】 利用转录组学比较野生型和Ras1CA过表达转基因家蚕后部丝腺中的基因转录本差异,经实时荧光定量PCRqRT-PCR)验证。【结果】 野生型家蚕和Ras1CA过表达转基因家蚕后部丝腺组织中有2 636个差异表达基因,其中细胞周期信号通路中有42个差异表达基因,包括细胞周期依赖性激酶(CDK)、细胞周期素(Cyclin)以及转录因子等。通过qRT-PCR检测cdk1cyclinD1cyclinD2cdc7cdh1dp-1,26个基因在野生型和Ras1CA过表达转基因家蚕后部丝腺组织中的相对表达量,发现转基因家蚕中的表达量均显著高于野生型(P<0.05),其中cyclinD2的表达差异极显著(P<0.01)。qRT-PCR结果与转录本差异一致,表明Ras1CA过表达后,能够促进细胞周期通路基因的表达。结论 野生型家蚕和Ras1CA过表达转基因家蚕后部丝腺中有大量差异表达基因,且Ras1CA能够在转录水平上调控细胞周期通路,影响后部丝腺组织的细胞分裂和器官生长,从而促进蚕丝蛋白的合成。

英文摘要:

[Objectives]  To further understand the molecular mechanisms underlying the overexpression of the Ras1CA oncogene in the posterior silk gland (PSG) of Bombyx mori and how this improves silk yield at the transcriptional level. Transcriptomic data from differentially expressed genes (DEGs) in the cell cycle pathway of Ras1CA-overexpressed and wild type PSG were analyzed and verified by quantitative real-time PCR (qRT-PCR). [Methods]  Deep RNA sequencing of silkworm PSG was carried out and KEGG pathway enrichment analysis was conducted on the DEGs. The DEGs in the cell cycle pathway was selected to be verified by qRT-PCR. [Results]  RNA-Seq revealed 2 636 DEGs in Ras1CA-overexpressed PSG compared to wild type PSG. There were 42 DEGs distributed in the “cell cycle” pathway, including cyclin dependent kinases (CDKs), cyclins and transcription factors. Consistent with the transcriptomic data, qRT-PCR verification of the selected genes; cdk1, cyclinD1, cyclinD2, cdc7, cdh1, dp-1,2, indicated that all of these were significantly upregulated by Ras1CA. [Conclusion]  Transcriptomic analysis revealed that there are a number of DEGs in Ras1CA-overexpressed and wild type PSG. Ras1CA-overexpression upregulates some DEGs in the cell cycle pathway that benefit silk gland growth and fibroin synthesis. These results advance our knowledge of the molecular mechanism underlying how Ras1CA-overexpression in the PSG improves fibroin production and silk production.

读者评论

      读者ID: 密码:   
我要评论:
版权所有©2024应用昆虫学报》编辑部 京ICP备10006425号
本系统由北京菲斯特诺科技有限公司设计开发
您是本站第8747602名访问者